Isoniazid No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Hazbón et al, 2006 katG S315T (AGC/ACC) 1011 403 608 184 0 45,7% 0,0% "Molecular beacon assay and sequencing. 240 alleles in katG, OxyR-ahpC, inhA, kasA, ndh" "Proportion method , BACTEC 460 and MGIT 960. 102 H, 272 MDR" Multiple countries katG S315N (AGC/AAC) 1011 403 608 9 0 2,2% 0,0% 1989-2002 katG S315T (AGC/ACA) 1011 403 608 21 0 5,2% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 1011 403 608 6 0 1,5% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 1011 403 608 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 1011 403 608 5 0 1,2% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 1011 403 608 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) 1011 403 608 36 87 8,9% 14,3% mabA, fabG1 -15 (C/T) 1011 403 608 31 0 7,7% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/A) 1011 403 608 3 0 0,7% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 1011 403 608 1 0 0,2% 0,0% ahpC -46 (G/A) 1011 403 608 14 11 3,5% 1,8% ahpC -39 (C/T) 1011 403 608 4 11 1,0% 1,8% ahpC I21T (ATC/ACC) 1011 403 608 2 0 0,5% 0,0% N/A Other c 1011 403 608 84 43 20,8% 7,1% c 15 isolates had 12 different other mutations in katG, 8 isolates had 2 different mutations in kasA, 14 isolates had 2 different mutations in ndh, 36 isolates had 14 different mutations in OxyR-ahpC, 11 isolates had 4 different mutations in mabA/fabG1. N/A None detected d 1011 403 608 88 467 21,8% 76,8% d 80/403 INH Res isolates contained more than one mutation Afanasev et al, 2007 katG S315T (AGC/ACC) 412 317 95 287 0 90,5% 0,0% "Primer extension minisequencing and sequencing. katG 315, inhA promoter" "Absolute concentration method. 57 H, 260 MDR " Russia katG S315N (AGC/AAC) 412 317 95 0 0 0,0% 0,0% 1997-2005 katG S315T (AGC/ACA) 412 317 95 1 0 0,3% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 412 317 95 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 412 317 95 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 412 317 95 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 412 317 95 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) 412 317 95 44 0 13,9% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/A) 412 317 95 1 0 0,3% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 412 317 95 2 0 0,6% 0,0% ahpC -46 (G/A) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -39 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC I21T (ATC/ACC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 412 317 95 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 412 317 95 26 95 8,2% 100,0% Huang et al, 2009 katG S315T (AGC/ACC) 272 242 30 122 0 50,4% 0,0% "Sequencing and MTBDRplus. katG, oxyR-ahpC, inhA promoter, inhA" Proportion method and MGIT 960. All MDR Taiwan katG S315N (AGC/AAC) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% 2007-2008 katG S315T (AGC/ACA) 272 242 30 1 0 0,4% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) 272 242 30 81 0 1,2% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/A) 272 242 30 3 0 2,9% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 272 242 30 7 0 0,0% 0,0% ahpC -46 (G/A) 272 242 30 0 0 0,4% 0,0% ahpC -39 (C/T) 272 242 30 1 0 0,0% 0,0% ahpC I21T (ATC/ACC) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 272 242 30 16 30 6,6% 100,0% Chan et al, 2007 katG S315T (AGC/ACC) 300 241 59 109 0 45,2% 0,0% "PCR-SSCP and sequencing. Whole gene katG, ahpC, inhA" "Absolute concentration method. 26 H, 213 MDR, 2 PDR" Hong Kong katG S315N (AGC/AAC) 300 241 59 5 0 2,1% 0,0% 1994-2004 katG S315T (AGC/ACA) 300 241 59 1 0 0,4% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/A) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% ahpC -46 (G/A) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% ahpC -39 (C/T) 300 241 59 0 0 0,0% 0,0% ahpC I21T (ATC/ACC) 300 241 59 2 0 0,8% 0,0% N/A Other b 300 241 59 48 1 19,9% 1,7% b 47 resistant isolates had 27 different other mutations in katG, 1 isolate had 1 other mutation in ahpC. 7 isolates had both katG S315T (AGC/ACC) mutations and other mutations. 2+1 isolates had 2+2 other mutations. N/A None detected 300 241 59 75 59 31,1% 100,0% Dalla Costa et al, 2009 katG S315T (AGC/ACC) 225 224 1 166 0 74,1% 0,0% "Sequencing. katG , oxyR-ahpC, inhA promoter, inhA " "Proportion method N.S." Brazil, Peru, Argentina katG S315N (AGC/AAC) 225 224 1 9 0 4,0% 0,0% 2003-2004 katG S315T (AGC/ACA) 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% "NOTE! Only one susceptible isolate included in the study. Study included since it is currently the only report from South America." katG S315I (AGC/ATC) 225 224 1 3 0 1,3% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) K 225 224 1 21 0 9,4% 0,0% K 3 isolates hade both mabA/fabG1 -15 C/T and katG S315T, 1 isolate both mabA/fabG1 -15 C/T and ahpC -6 G/A, 7 isolates both mabA/fabG1 -15 C/T and ahpC -46 G/A mutations mabA, fabG1 -8 (T/A) 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% ahpC -46 (G/A) L 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% L 1 isolate had both katG deletion and ahpC -46 G/A mutation ahpC -39 (C/T) 225 224 1 3 0 1,3% 0,0% ahpC I21T (ATC/ACC) 225 224 1 0 0 0,0% 0,0% N/A Other M 225 224 1 22 0 9,8% 0,0% M 6 isolates had 4 different other mutations (mabA/fabG1 -24C/T and ahpC -6 G/A , -30 C/T and -34 T/A) 1 isolate hade both -46G/A and -34 T/A mutations, 1 isolate had both katG S315T, inh -24 C/T and ahpC -46 G/A mutations. N/A None detected 225 224 1 20 1 8,9% 100,0% Baker et al, 2005 katG S315T (AGC/ACC) 378 202 176 118 0 58,4% 0,0% "Oligobased hybridization assay and Sequencing. katG 315, oxyR-ahpC, inhA promoter" "Resistance ratio method. 107 H, 47 MDR, 48 PDR" UK katG S315N (AGC/AAC) 378 202 176 0 0 0,0% 0,0% 1998 katG S315T (AGC/ACA) 378 202 176 1 0 0,5% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 378 202 176 1 0 0,5% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 378 202 176 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 378 202 176 2 0 1,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 378 202 176 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) K 378 202 176 53 1 26,2% 0,6% K 3 isolates hade both mabA/fabG1 -15 C/T and katG S315T, 1 isolate both mabA/fabG1 -15 C/T and ahpC -6 G/A, 7 isolates both mabA/fabG1 -15 C/T and ahpC -46 G/A mutations mabA, fabG1 -8 (T/A) 378 202 176 0 1 0,0% 0,6% mabA, fabG1 -8 (T/C) 378 202 176 1 0 0,5% 0,0% ahpC -46 (G/A) L 378 202 176 48 13 23,8% 7,4% L 1 isolate had both katG deletion and ahpC -46 G/A mutation ahpC -39 (C/T) 378 202 176 0 0 0,0% 0,0% ahpC I21T (ATC/ACC) 378 202 176 0 0 0,0% 0,0% N/A Other M 378 202 176 6 1 3,0% 0,6% M 6 isolates had 4 different other mutations (mabA/fabG1 -24C/T and ahpC -6 G/A , -30 C/T and -34 T/A) 1 isolate hade both -46G/A and -34 T/A mutations, 1 isolate had both katG S315T, inh -24 C/T and ahpC -46 G/A mutations. N/A None detected 378 202 176 21 160 10,4% 90,9% Miotto et al, 2006 katG S315T (AGC/ACC) 209 176 33 114 0 64,8% 0,0% "Sequencing and Oligobased hybridization assay. katG315 region and inhA promoter region around-15" "Proportion method , BACTEC 460 and MGIT 960. 16 H, 139 MDR, 18 PDR" Italy katG S315N (AGC/AAC) 209 176 33 1 0 0,6% 0,0% 2002-2005 katG S315T (AGC/ACA) 209 176 33 1 0 0,6% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 209 176 33 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 209 176 33 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 209 176 33 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) 209 176 33 20 0 11,4% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/A) 209 176 33 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 209 176 33 0 0 0,0% 0,0% ahpC -46 (G/A) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -39 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC I21T (ATC/ACC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other e 209 176 33 1 0 0,6% 0,0% e 1 isolate had 5 different other mutations N/A None detected 209 176 33 36 33 20,5% 100,0% "Isoniazid Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Parsons et al, 2005 katG S315T (AGC/ACC) 157 147 10 62 0 42,2% 0,0% "Sequencing. Around katG 315" "Proportion method, BACTEC 460. 99 MDR, different patterns of H, E, R, S and Z resistance" USA katG S315N (AGC/AAC) 157 147 10 5 0 3,4% 0,0% 1999-2004 katG S315T (AGC/ACA) 157 147 10 30 0 20,4% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) J 157 147 10 2 0 1,4% 0,0% J 1 isolate contained a mixed population with S315R/L/I mutations katG S315R (AGC/AGA) J 157 147 10 1 0 0,7% 0,0% katG katG deletion 157 147 10 1 0 0,7% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -8 (T/A) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -8 (T/C) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -46 (G/A) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -39 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC I21T (ATC/ACC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 157 147 10 1 0 0,7% 0,0% N/A None detected 157 147 10 46 10 31,3% 100,0% Bolotin et al, 2009 katG S315T (AGC/ACC) 504 154 350 66 0 42,9% 0,0% "Sequencing. katG, inhA promoter" "Bactec 460, MGIT 960. N.S." Canada katG S315N (AGC/AAC) 504 154 350 2 0 1,3% 0,0% 1999-2001 katG S315T (AGC/ACA) 504 154 350 0 0 0,0% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 504 154 350 1 0 0,6% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 504 154 350 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 504 154 350 2 0 1,3% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 504 154 350 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) g 504 154 350 39 0 25,3% 0,0% g mutations in mabA/fabG1 promoter region and ahpC was only tested for when no katG 315 mutation was found mabA, fabG1 -8 (T/A) g 504 154 350 1 0 0,6% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) g 504 154 350 2 0 1,3% 0,0% ahpC -46 (G/A) g N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -39 (C/T) g N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC I21T (ATC/ACC) g N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 504 154 350 6 0 3,9% 0,0% N/A None detected 504 154 350 39 350 25,3% 100,0% Hillemann et al, 2005 katG S315T (AGC/ACC) 152 142 10 137 0 96,5% 0,0% "PCR FRET assay and Sequencing. katG, OxyR-ahpC, and inhA promoter " "N.S. 50 H, 92 MDR" Kazaksthan katG S315N (AGC/AAC) 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% 2004 katG S315T (AGC/ACA) 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 152 142 10 1 0 0,7% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) g 152 142 10 3 0 2,1% 0,0% g mutations in mabA/fabG1 promoter region and ahpC was only tested for when no katG 315 mutation was found mabA, fabG1 -8 (T/A) g 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) g 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% ahpC -46 (G/A) g 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% ahpC -39 (C/T) g 152 142 10 1 0 0,7% 0,0% ahpC I21T (ATC/ACC) g 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 152 142 10 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 152 142 10 0 10 0,0% 100,0% Park et al, 2006 katG S315T (AGC/ACC) 243 119 124 37 0 31,1% 0,0% "Oligobased hybridization assay and Sequencing. katG and inhA " "Proportion method. 7 H, 112 MDR" South Korea katG S315N (AGC/AAC) 243 119 124 5 0 4,2% 0,0% N.S. katG S315T (AGC/ACA) 243 119 124 0 0 0,0% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 243 119 124 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 243 119 124 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 243 119 124 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) f 243 119 124 56 3 47,1% 2,4% f mabA/fabG1 -15 (C/T) was found in 56 INH Res of which 13 had the katG S315T (AGC/ACC) mutation mabA, fabG1 -8 (T/A) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -8 (T/C) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -46 (G/A) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -39 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC I21T (ATC/ACC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 243 119 124 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 243 119 124 34 121 28,6% 97,6% Wu et al, 2006 katG S315T (AGC/ACC) 204 106 98 60 26 56,6% 26,5% "Reverse Dot Blot Hybridization (RDBH) and sequencing. katG:273bp fragment, inhA:255bp fragment" "Absolute concentration method. 1 H, 86 MDR, 19 PDR" China katG S315N (AGC/AAC) 204 106 98 2 2 1,9% 2,0% 1999-2004 katG S315T (AGC/ACA) 204 106 98 0 0 0,0% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 204 106 98 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 204 106 98 1 0 0,9% 0,0% katG katG deletion 204 106 98 10 0 9,4% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 204 106 98 14 0 13,2% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15(C/T)a 204 106 98 22 3 20,8% 3,1% a 4 isolates had both katG S315T (AGC/ACC) and mabA/fabG1 -15 (C/T) mutations mabA, fabG1 -8 (T/A) 204 106 98 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 204 106 98 0 0 0,0% 0,0% ahpC -46 (G/A) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC -39 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A ahpC I21T (ATC/ACC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 204 106 98 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 204 106 98 14 67 13,2% 68,4% Boonaiam et al, 2006 katG S315T (AGC/ACC) 170 160 10 92 0 57,5% 0,0% "Sequencing. katG , oxyR-ahpC, ndh, inhA promoter, inhA " "Proportion method. 26 H, 110 MDR, 24 PDR" Thailand katG S315N (AGC/AAC) 170 160 10 1 0 0,6% 0,0% 2005-2006 katG S315T (AGC/ACA) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 170 160 10 1 0 0,6% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15(C/T) 170 160 10 17 0 10,6% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/A) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) 170 160 10 1 0 0,6% 0,0% ahpC -46 (G/A) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% ahpC -39 (C/T) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% ahpC I21T (ATC/ACC) 170 160 10 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 170 160 10 29 0 18,1% 0,0% N/A None detected 170 160 10 4 10 2,5% 100,0% Hillemann et al, 2005 katG S315T (AGC/ACC) 143 103 40 87 0 84,5% 0,0% "Oligobased hybridization assay and sequencing. katG 315, ahpC, inhA" "BACTEC 460. All MDR" Germany katG S315N (AGC/AAC) 143 103 40 2 0 1,9% 0,0% 2001 katG S315T (AGC/ACA) 143 103 40 2 0 1,9% 0,0% katG S315I (AGC/ATC) 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% katG S315R (AGC/AGA) 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% katG katG deletion 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% katG G279D (GGC/GAC) 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% kasA G269S (GGT/AGT) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A mabA, fabG1 -15 (C/T) h 143 103 40 3 0 2,9% 0,0% h mutations in mabA/fabG1 promoter region and ahpC was only tested for when no katG 315 mutation was found mabA, fabG1 -8 (T/A) h 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% mabA, fabG1 -8 (T/C) h 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% ahpC -46 (G/A) h 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% ahpC -39 (C/T) h 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% ahpC I21T (ATC/ACC) h 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% N/A Other I 143 103 40 2 0 1,9% 0,0% I 2 isolates had 2 different other mutations (ahpC -52 C/T and -48 G/A) N/A None detected 143 103 40 7 40 6,8% 100,0% Rifampin No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Tatkov et al, 2007 rpoB L511P ( CTG/CCG) 290 272 18 13 0 4,8% 0,0% "Oligobased chip assay, PCR-SSCP and sequencing. RRDR" "Absolute concentration method. 94% MDR" Russia rpoB Q513L (CAA/CTA) 290 272 18 0 0 0,0% 0,0% 2000-2005 rpoB D516V (GAC/GTC) 290 272 18 10 0 3,7% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 290 272 18 3 0 1,1% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 290 272 18 2 0 0,7% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 290 272 18 10 0 3,7% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 290 272 18 4 0 1,5% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 290 272 18 1 0 0,4% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 290 272 18 1 0 0,4% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 290 272 18 0 0 0,0% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 290 272 18 176 0 64,7% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 290 272 18 2 0 0,7% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 290 272 18 5 0 1,8% 0,0% N/A Other AB 290 272 18 7 0 2,6% 0,0% AB 7 isolates had 4 different other mutations S512T, Q513G, S531C, S531N N/A None detected 290 272 18 38 18 14,0% 100,0% Afanasev et al, 2007 rpoB L511P ( CTG/CCG) 412 271 141 3 0 1,1% 0,0% "Primer extension minisequencing and sequencing. RRDR " "Absolute concentration method. 11 R, 260 MDR" Russia rpoB Q513L (CAA/CTA) 412 271 141 0 0 0,0% 0,0% 1997-2005 rpoB D516V (GAC/GTC) N 412 271 141 18 0 6,6% 0,0% N 1 isolate had both L511P and D516G (GAC/GGC) mutations rpoB D516Y (GAC/TAC) 412 271 141 0 0 0,0% 0,0% N 1 isolate had both L511P and D516G (GAC/GGC) mutations rpoB S522L (TCG/TTG) 412 271 141 0 0 0,0% 0,0% N 1 isolate had both L511P and D516G (GAC/GGC) mutations rpoB H526Y (CAC/TAC) 412 271 141 10 0 3,7% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 412 271 141 11 0 4,1% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 412 271 141 9 0 3,3% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 412 271 141 2 0 0,7% 0,0% O 1 isolate had both S531W and H526L mutations rpoB H526N (CAC/AAC) 412 271 141 3 0 1,1% 0,0% O 1 isolate had both S531W and H526L mutations rpoB S531L (TCG/TTG) O 412 271 141 177 0 65,3% 0,0% P 4 isolates had both S531 L and H526Y, 1 isolate S531L and H526D, 1 isolate S531L and H526R mutations rpoB S531W (TCG/TGG) P 412 271 141 6 0 2,2% 0,0% Q 1 isolate had both S531W and H526L mutations rpoB L533P (CTG/CCG) Q 412 271 141 4 0 1,5% 0,0% N/A Other R 412 271 141 6 0 2,2% 0,0% R 6 isolates had 4 different other mutations [D516V (GAC/GTA), D516G (GAC/GGC), 514 ins TTC, Q513P (CAA/CCA)] N/A None detected 412 271 141 30 141 11,1% 100,0% Huang et al, 2009 rpoB L511P ( CTG/CCG) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing and MTBDRplus. katG, oxyR-ahpC, inhA promoter, inhA" Proportion method and MGIT 960. All MDR Taiwan rpoB Q513L (CAA/CTA) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% 2007-2008 rpoB D516V (GAC/GTC) 272 242 30 6 0 2,5% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 272 242 30 23 0 9,5% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 272 242 30 8 0 3,3% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 272 242 30 9 0 3,7% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 272 242 30 146 0 60,3% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 272 242 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 272 242 30 13 0 5,4% 0,0% N/A Other 272 242 30 0 0,0% 0,0% N/A None detected 272 242 30 5 30 2,1% 100,0% Chan et al, 2007 rpoB L511P ( CTG/CCG) S 300 221 79 2 0 0,9% 0,0% "PCR-SSCP and Sequencing. RRDR" "Absolute concentration method. 6 R, 213 MDR, 2 PDR" S 1 isolate had both L511P and N518D (AAC/GAC) and 1 isolate both L511P and S512G (AGC/GGC) mutations Hong Kong rpoB Q513L (CAA/CTA) 300 221 79 4 0 1,8% 0,0% 1994-2004 rpoB D516V (GAC/GTC) 300 221 79 2 0 0,9% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 300 221 79 2 1 0,9% 1,3% rpoB S522L (TCG/TTG) 300 221 79 2 1 0,9% 1,3% rpoB H526Y (CAC/TAC) 300 221 79 26 0 11,8% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 300 221 79 7 0 3,2% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 300 221 79 7 0 3,2% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 300 221 79 2 1 0,9% 1,3% rpoB H526N (CAC/AAC) 300 221 79 1 0 0,5% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) T 300 221 79 136 0 61,5% 0,0% T 1 isolate had both S531L and Q513L and 1 isolate both S531L and H526D mutations rpoB S531W (TCG/TGG) 300 221 79 1 0 0,5% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) U 300 221 79 6 0 2,7% 0,0% U 1 isolate had both L533P and N518D (AAC/GAC) mutations N/A Other V 300 221 79 13 1 5,9% 1,3% V 13 isolates had 9 different other mutations. 1 isolate had both D516Y and F505L (TTC/GTC) mutations N/A None detected 300 221 79 15 77 6,8% 97,5% Yip et al, 2006 rpoB L511P ( CTG/CCG) 3299 216 3083 6 7 2,8% 0,2% "dHPLC and Sequencing. RRDR" "Absolute concentration method. Only information about R resistance " Hong Kong rpoB Q513L (CAA/CTA) 3299 216 3083 0 0 0,0% 0,0% 1999-2003 rpoB D516V (GAC/GTC) 3299 216 3083 1 0 0,5% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 3299 216 3083 0 0 0,0% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 3299 216 3083 2 0 0,9% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 3299 216 3083 25 0 11,6% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 3299 216 3083 23 0 10,6% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 3299 216 3083 5 0 2,3% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 3299 216 3083 5 0 2,3% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) AC 3299 216 3083 3 0 1,4% 0,0% AC 1 isolate had both H526N and L511P mutations rpoB S531L (TCG/TTG) 3299 216 3083 112 0 51,9% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 3299 216 3083 1 0 0,5% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 3299 216 3083 16 0 7,4% 0,0% N/A Other AD 3299 216 3083 12 0 5,6% 0,0% AD 12 isolates had 9 different other mutations. 1 isolate had both L511P and M515I (ATG/ATA), 1 both L511P and S512G (AGC/GGC), 1 both H526L and L511R (CTG/CGG), 1 both L533P and N518D (AAC/GAC), 3 both H516N and A532V mutations. N/A None detected 3299 216 3083 12 3076 5,6% 99,8% Sivkov et al, 2006 rpoB L511P ( CTG/CCG) 170 166 4 14 0 8,4% 0,0% "Oligobased chip assay, PCR-SSCP and sequencing. RRDR" "Absolute concentration method. All R monoresistant" Russia rpoB Q513L (CAA/CTA) 170 166 4 0 0 0,0% 0,0% 2000-2002 rpoB D516V (GAC/GTC) 170 166 4 6 0 3,6% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 170 166 4 3 0 1,8% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 170 166 4 1 0 0,6% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 170 166 4 8 0 4,8% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 170 166 4 1 0 0,6% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 170 166 4 1 0 0,6% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 170 166 4 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 170 166 4 0 0 0,0% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 170 166 4 97 0 58,4% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 170 166 4 1 0 0,6% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 170 166 4 1 0 0,6% 0,0% N/A Other AA 170 166 4 6 0 3,6% 0,0% AA 6 isolates had 4 different other mutations. 3 isolates had both D516Y and Q513G mutations. N/A None detected 170 166 4 27 4 16,3% 100,0% Jou et al, 2005 rpoB L511P ( CTG/CCG) 202 162 40 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing RRDR 541 bp region" "N.S. All MDR" Taiwan rpoB Q513L (CAA/CTA) 202 162 40 0 0 0,0% 0,0% 1998-2003 rpoB D516V (GAC/GTC) 202 162 40 4 0 2,5% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 202 162 40 5 0 3,1% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 202 162 40 2 0 1,2% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 202 162 40 14 0 8,6% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 202 162 40 5 0 3,1% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 202 162 40 3 0 1,9% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 202 162 40 5 0 3,1% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 202 162 40 1 0 0,6% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 202 162 40 75 0 46,3% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 202 162 40 2 0 1,2% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 202 162 40 6 0 3,7% 0,0% N/A Other 202 162 40 31 0 19,1% 0,0% 31 isolates had 21 different other mutations. N/A None detected 202 162 40 16 40 9,9% 100,0% "Rifampin Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Prammananan et al, 2008 rpoB L511P ( CTG/CCG) 184 154 30 0 0 0,0% 0,0% "MAS-PCR and Sequencing. RRDR and 365bp N-terminal" "Proportion method. 11R, 143 MDR" Thailand rpoB Q513L (CAA/CTA) 184 154 30 0 0 0,0% 0,0% 2003-2005 rpoB D516V (GAC/GTC) 184 154 30 12 0 7,8% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 184 154 30 1 0 0,6% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 184 154 30 2 0 1,3% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 184 154 30 23 0 14,9% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 184 154 30 5 0 3,2% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 184 154 30 5 0 3,2% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 184 154 30 6 0 3,9% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 184 154 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 184 154 30 87 0 56,5% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 184 154 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 184 154 30 3 0 1,9% 0,0% N/A Other 184 154 30 14 0 9,1% 0,0% N/A None detected 184 154 30 0 30 0,0% 100,0% Suresh et al, 2006 rpoB L511P ( CTG/CCG) 187 149 38 2 0 1,3% 0,0% "Sequencing. RRDR 437bp fragment" "Proportion method. All MDR " India rpoB Q513L (CAA/CTA) 187 149 38 0 0 0,0% 0,0% 2001-2003 rpoB D516V (GAC/GTC) 187 149 38 11 0 7,4% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 187 149 38 6 0 4,0% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 187 149 38 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 187 149 38 16 0 10,7% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 187 149 38 7 0 4,7% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 187 149 38 6 0 4,0% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 187 149 38 1 0 0,7% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 187 149 38 0 0 0,0% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 187 149 38 85 0 57,0% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 187 149 38 2 0 1,3% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 187 149 38 6 0 4,0% 0,0% N/A Other Z 187 149 38 5 0 3,4% 0,0% Z 5 isolates had 3 different other mutations [Q513R (CAA/CGA), 513 ins TTC, H516E (CAC/CAA)] N/A None detected 187 149 38 3 38 2,0% 100,0% Miotto et al, 2006 rpoB L511P ( CTG/CCG) 206 142 64 2 1 1,4% 1,6% "Oligobased hybridization assay and sequencing. RRDR" "BACTEC 460, MGIT 960 and proportion method. 3 R, 139 MDR, 18 PDR " Italy rpoB Q513L (CAA/CTA) 206 142 64 1 0 0,7% 0,0% 2002-2005 rpoB D516V (GAC/GTC) 206 142 64 11 1 7,7% 1,6% rpoB D516Y (GAC/TAC) 206 142 64 2 0 1,4% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 206 142 64 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 206 142 64 10 0 7,0% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 206 142 64 3 0 2,1% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 206 142 64 1 0 0,7% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 206 142 64 1 0 0,7% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 206 142 64 2 0 1,4% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 206 142 64 87 0 61,3% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 206 142 64 2 0 1,4% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) W 206 142 64 3 2 2,1% 3,1% w 1 isolate had both D516Y andL533P mutations N/A Other X 206 142 64 17 0 12,0% 0,0% X 17 isolates had 14 different other mutations N/A None detected 206 142 64 8 61 5,6% 95,3% Park et al, 2006 rpoB L511P ( CTG/CCG) 243 115 128 1 0 0,9% 0,0% "Oligobased hybridization assay and sequencing. RRDR 511-533" "Proportion method. 3 R, 112 MDR " Korea rpoB Q513L (CAA/CTA) 243 115 128 1 0 0,9% 0,0% N.S. rpoB D516V (GAC/GTC) 243 115 128 10 0 8,7% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 243 115 128 3 0 2,6% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 243 115 128 2 0 1,7% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 243 115 128 7 0 6,1% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 243 115 128 7 0 6,1% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 243 115 128 6 0 5,2% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 243 115 128 4 0 3,5% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 243 115 128 0 0 0,0% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 243 115 128 60 0 52,2% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 243 115 128 0 0 0,0% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 243 115 128 3 2 2,6% 1,6% N/A Other Y 243 115 128 3 0 2,6% 0,0% Y 3 isolates had an undefined mutation in Q513? N/A None detected 243 115 128 8 126 7,0% 98,4% Wang et al, 2007 rpoB L511P ( CTG/CCG) 142 112 30 3 0 2,7% 0,0% "Sequencing. Whole rpoB and Rv2629" "Proportion method and MGIT 960. N.S." China rpoB Q513L (CAA/CTA) 142 112 30 0 0 0,0% 0,0% N.S. rpoB D516V (GAC/GTC) 142 112 30 2 0 1,8% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 142 112 30 1 0 0,9% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 142 112 30 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 142 112 30 9 0 8,0% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 142 112 30 7 0 6,3% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 142 112 30 4 0 3,6% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 142 112 30 11 0 9,8% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 142 112 30 3 0 2,7% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 142 112 30 35 0 31,3% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 142 112 30 15 0 13,4% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 142 112 30 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 142 112 30 11 0 9,8% 0,0% N/A None detected 142 112 30 11 30 9,8% 100,0% Tho et al, 2008 rpoB L511P ( CTG/CCG) 154 104 50 3 0 2,9% 0,0% "MAS-PCR, MTBDR assay and Sequencing. RRDR 81bp" "Proportion method. 2R, 102 MDR" Vietnam rpoB Q513L (CAA/CTA) 154 104 50 1 0 1,0% 0,0% 2005 rpoB D516V (GAC/GTC) 154 104 50 10 0 9,6% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 154 104 50 0 0 0,0% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 154 104 50 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 154 104 50 14 0 13,5% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 154 104 50 7 0 6,7% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 154 104 50 5 0 4,8% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 154 104 50 1 0 1,0% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 154 104 50 2 0 1,9% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 154 104 50 46 0 44,2% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 154 104 50 0 0 0,0% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 154 104 50 5 0 4,8% 0,0% N/A Other 154 104 50 19 0 18,3% 0,0% "19 isolates had 11 other different mutations; V146F, S512G, Q513K, 514INS::TTC, D516A, D516G, 521INS::TCGGGGTTG, H526Q, H526S, H526F, I561V." N/A None detected 154 104 50 4 50 3,8% 100,0% Sun et al, 2009 rpoB L511P ( CTG/CCG) 235 102 133 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing Whole rpoB" "Proportion method. N.S" China rpoB Q513L (CAA/CTA) 235 102 133 0 0 0,0% 0,0% 2005-2006 rpoB D516V (GAC/GTC) 235 102 133 6 0 5,9% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 235 102 133 2 0 2,0% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 235 102 133 0 0 0,0% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 235 102 133 13 0 12,7% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 235 102 133 15 0 14,7% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 235 102 133 11 0 10,8% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 235 102 133 11 0 10,8% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 235 102 133 0 0 0,0% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 235 102 133 41 0 40,2% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 235 102 133 0 0 0,0% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 235 102 133 3 0 2,9% 0,0% N/A Other 235 102 133 0 3 0,0% 2,3% N/A None detected 235 102 133 3 130 2,9% 97,7% "Fluoroquinolones " No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Hillemann et al, 2005 rpoB L511P ( CTG/CCG) 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% "Real-time PCR, MTBDR assay and Sequencing. RRDR 81bp" "BACTEC 460. All MDR" Germany rpoB Q513L (CAA/CTA) 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% 2001 rpoB D516V (GAC/GTC) 143 103 40 2 0 1,9% 0,0% rpoB D516Y (GAC/TAC) 143 103 40 1 0 1,0% 0,0% rpoB S522L (TCG/TTG) 143 103 40 2 0 1,9% 0,0% rpoB H526Y (CAC/TAC) 143 103 40 2 0 1,9% 0,0% rpoB H526D (CAC/GAC) 143 103 40 1 0 1,0% 0,0% rpoB H526R (CAC/CGC) 143 103 40 3 0 2,9% 0,0% rpoB H526L (CAC/CTC) 143 103 40 3 0 2,9% 0,0% rpoB H526N (CAC/AAC) 143 103 40 4 0 3,9% 0,0% rpoB S531L (TCG/TTG) 143 103 40 74 0 71,8% 0,0% rpoB S531W (TCG/TGG) 143 103 40 3 0 2,9% 0,0% rpoB L533P (CTG/CCG) 143 103 40 0 0 0,0% 0,0% N/A Other AE 143 103 40 10 0 9,7% 0,0% AE 10 isolates had 9 different other mutations V176F (GTC/TTC), Q513P (CAA/CCA), 514-516 del, 517 del, N518I (AAC/ATC), 519 del, S522Q (TCG/CAG), H526C (CAC/TGC), S531F (TCG/TTT) N/A None detected 143 103 40 1 40 1,0% 100,0% Shi et al, 2006 gyrA A74S (GCC/TCC) 109 87 22 10 0 11,5% 0,0% "DHPLC and Sequencing. gyrA: codon 74-95" "Absolute concentration method. N.S." China gyrA A90V (GCG/GTG) 109 87 22 47 2 54,0% 9,1% 2002-2003 gyrA S91P (TCG/CCG) AF 109 87 22 10 1 11,5% 4,5% AF 9 isolates had both S91P and A90V mutations gyrA D94G (GAC/GGC) AG 109 87 22 42 1 48,3% 4,5% AG 10 isolates had both D94G and A74S mutations and 26 had both D94G and A90V mutations gyrA D94N (GAC/AAC) AH 109 87 22 25 0 28,7% 0,0% AH 7 isolates had both D94N and A90V mutations gyrA D94A (GAC/GCC) 109 87 22 1 0 1,1% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 109 87 22 3 0 3,4% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 109 87 22 0 0 0,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 109 87 22 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 109 87 22 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 109 87 22 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 109 87 22 1 18 1,1% 81,8% Sulochana et al, 2007 AI gyrA A74S (GCC/TCC) 118 72 46 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. QRDR of gyrA and gyrB" "Absolute concentration method. 38 O, 31 MDR, 2 PDR" AI In order to be more in line with the other studies I counted isolates with moderate sensitivity (2mg/L) as resistant. India gyrA A90V (GCG/GTG) 118 72 46 7 0 9,7% 0,0% N.S. gyrA S91P (TCG/CCG) 118 72 46 1 0 1,4% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 118 72 46 10 0 13,9% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 118 72 46 1 0 1,4% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 118 72 46 11 0 15,3% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 118 72 46 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 118 72 46 0 0 0,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 118 72 46 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 118 72 46 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) AJ 118 72 46 0 0 N/A N/A AJ Only 2 OFL resistant isolates without gyrA mutations were screened for gyrB mutations N/A Other AK 118 72 46 3 1 4,2% 2,2% AK 2 isolates had two different other mutations. L109V (CTG/GTG) and D94V (GAC/GTC) N/A None detected 118 72 46 39 45 54,2% 97,8% Chan et al, 2007 gyrA A74S (GCC/TCC) 250 71 179 0 0 0,0% 0,0% "PCR-SSCP and Sequencing. QRDR of gyrA" "Absolute concentration method. 69 MDR, 2 PDR" Hong Kong gyrA A90V (GCG/GTG) 250 71 179 10 0 14,1% 0,0% 1994-2004 gyrA S91P (TCG/CCG) 250 71 179 4 0 5,6% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 250 71 179 19 0 26,8% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 250 71 179 1 0 1,4% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 250 71 179 6 1 8,5% 0,6% gyrA D94Y (GAC/TAC) 250 71 179 7 0 9,9% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 250 71 179 5 0 7,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) AL 250 71 179 1 0 1,4% 0,0% AL 1 Isolate had both A90V and P102H mutations. gyrA A126R (GCG/AGG) 250 71 179 2 0 2,8% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC)* N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other AM 250 71 179 1 0 1,4% 0,0% AM G88C (GGC/TGC). N/A None detected 250 71 179 16 178 22,5% 99,4% Siddiqi et al, 2002 gyrA A74S (GCC/TCC) 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. gyrA: codon 89-95 and fragment of gyrB" "Proportion method. 18 O, 18 MDR, 33 PDR" India gyrA A90V (GCG/GTG) 128 69 59 2 0 2,9% 0,0% 1995-1998 gyrA S91P (TCG/CCG) 128 69 59 1 0 1,4% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 128 69 59 2 0 2,9% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 128 69 59 2 0 2,9% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 128 69 59 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected* 128 69 59 62 59 89,9% 100,0% Antonova et al, 2008 gyrA A74S (GCC/TCC) 185 67 118 0 0 0,0% 0,0% "Oligobased chip assay and sequencing. QRDR of gyrA " "Absolute concentration method. N.S." Russia gyrA A90V (GCG/GTG) 185 67 118 13 3 19,4% 2,5% N.S. gyrA S91P (TCG/CCG) AF 185 67 118 6 0 9,0% 0,0% AF 9 isolates had both S91P and A90V mutations gyrA D94G (GAC/GGC) AG 185 67 118 1 0 1,5% 0,0% AG 10 isolates had both D94G and A74S mutations and 26 had both D94G and A90V mutations gyrA D94N (GAC/AAC) AH 185 67 118 8 0 11,9% 0,0% AH 7 isolates had both D94N and A90V mutations gyrA D94A (GAC/GCC) 185 67 118 7 0 10,4% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 185 67 118 5 0 7,5% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 185 67 118 1 0 1,5% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 185 67 118 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 185 67 118 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 185 67 118 1 0 1,5% 0,0% N/A None detected 185 67 118 5 115 7,5% 97,5% Park et al, 2005 gyrA A74S (GCC/TCC) 73 63 10 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. QRDR of gyrA and gyrB" "Proportion method. All O resistant and different patterns of resistance to other FLQs" South Korea gyrA A90V (GCG/GTG) 73 63 10 12 0 19,0% 0,0% 2004 gyrA S91P (TCG/CCG) 73 63 10 6 0 9,5% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 73 63 10 21 0 33,3% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 73 63 10 2 0 3,2% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 73 63 10 6 0 9,5% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 73 63 10 1 0 1,6% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 73 63 10 2 0 3,2% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 73 63 10 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 73 63 10 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) 73 63 10 0 0 0,0% 0,0% N/A Other AO 73 63 10 1 0 1,6% 0,0% AN G88A (GGC/GCC) N/A None detected 73 63 10 12 10 19,0% 100,0% "Fluoroquinolones Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Cheng et al, 2004 gyrA A74S (GCC/TCC) 138 55 83 0 0 0,0% 0,0% "PCR-SSCP and sequencing. gyrA: 320bp fragment" "Absolute concentration and broth macrodilution methods. Among 138 isolates 92 were MDR, among these 55 were O resistant" Hong Kong gyrA A90V (GCG/GTG) 138 55 83 5 0 9,1% 0,0% 1991-2000 gyrA S91P (TCG/CCG) 138 55 83 4 0 7,3% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 138 55 83 11 0 20,0% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 138 55 83 1 0 1,8% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 138 55 83 3 0 5,5% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 138 55 83 5 0 9,1% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 138 55 83 3 0 5,5% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 138 55 83 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 138 55 83 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 138 55 83 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 138 55 83 23 0 41,8% 0,0% Lee et al, 2002 gyrA A74S (GCC/TCC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. QRDR of gyrA and gyrB" "BACTEC 460. Resistant to at least one additional drug (H, R, S, E)" Singapore gyrA A90V (GCG/GTG) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% N.S gyrA S91P (TCG/CCG) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) 100 53 47 0 0 0,0% 0,0% N/A Other AO 100 53 47 1 0 1,9% 0,0% AO 1 resistant isolate had a mutation in gyrB D505A (GAC/GCC) N/A None detected 100 53 47 52 47 98,1% 100,0% Mokrousov et al, 2008 gyrA A74S (GCC/TCC) 70 48 22 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. QRDR of gyrA and gyrB" "Absolute concentration method. 45 XDR, 3 MDR" Russia gyrA A90V (GCG/GTG) 70 48 22 8 0 16,7% 0,0% 2006 gyrA S91P (TCG/CCG) 70 48 22 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 70 48 22 19 0 39,6% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 70 48 22 10 0 20,8% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 70 48 22 3 0 6,3% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 70 48 22 9 0 18,8% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 70 48 22 0 0 0,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 70 48 22 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 70 48 22 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) 70 48 22 0 0 N/A N/A N/A Other* 70 48 22 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 70 48 22 8 22 16,7% 100,0% Zhao et al, 2004 gyrA A74S (GCC/TCC) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% "PCR-SSCP and Sequencing. QRDR of gyrA" "Absolute concentration method. N.S." China gyrA A90V (GCG/GTG) 68 44 24 15 7 34,1% 29,2% N.S gyrA S91P (TCG/CCG) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 68 44 24 16 4 36,4% 16,7% gyrA D94N (GAC/AAC) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 68 44 24 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other* 68 44 24 15 0 34,1% 0,0% N/A None detected 68 44 24 8 14 18,2% 58,3% An et al, 2005 gyrA A74S (GCC/TCC) 75 42 33 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing, PCR-SSCP. QRDR of gyrA" "Proportion method. All monoresistant" China gyrA A90V (GCG/GTG) 75 42 33 10 0 23,8% 0,0% N.S. gyrA S91P (TCG/CCG) 75 42 33 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 75 42 33 15 0 35,7% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 75 42 33 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 75 42 33 2 0 4,8% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 75 42 33 4 0 9,5% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 75 42 33 3 0 7,1% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 75 42 33 0 0 0,0% 0,0% gyrA A126R (GCG/AGG) 75 42 33 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 75 42 33 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 75 42 33 8 33 19,0% 100,0% van Doorn et al, 2008 gyrA A74S (GCC/TCC) 82 42 40 0 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. QRDR of gyrA" "Absolute concentration method and MGIT 960. 24 MDR, 11 O or PDR" Vietnam gyrA A90V (GCG/GTG) 82 42 40 15 0 35,7% 0,0% 2005-2006 gyrA S91P (TCG/CCG) 82 42 40 1 0 2,4% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 82 42 40 12 0 28,6% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 82 42 40 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 82 42 40 5 0 11,9% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 82 42 40 1 0 2,4% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 82 42 40 0 0 0,0% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) 82 42 40 0 0 0 0,0% 0,0% AP 2 isolates with both P102H and A90V mutations gyrA A126R (GCG/AGG) 82 42 40 0 0 0 0,0% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 82 42 40 2 0 4,8% 0,0% N/A None detected 82 42 40 10 40 23,8% 100,0% Kam et al, 2006* gyrA A74S (GCC/TCC) 55 35 20 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. QRDR of gyrA" "Absolute concentration method and MGIT 960. 24 MDR, 11 O or PDR" * Sequencing was preformed for isolates with OFL MIC >= 4 ug/ml, MIC <= 2ug/ml was defined as OFL sensitive Hong Kong gyrA A90V (GCG/GTG) 55 35 20 10 0 28,6% 0,0% 1999-2003 gyrA S91P (TCG/CCG) 55 35 20 1 0 2,9% 0,0% gyrA D94G (GAC/GGC) 55 35 20 12 0 34,3% 0,0% gyrA D94N (GAC/AAC) 55 35 20 0 0 0,0% 0,0% gyrA D94A (GAC/GCC) 55 35 20 5 0 14,3% 0,0% gyrA D94Y (GAC/TAC) 55 35 20 2 0 5,7% 0,0% gyrA D94H (GAC/CAC) 55 35 20 1 0 2,9% 0,0% gyrA P102H (CCC/CAC) AP 55 35 20 2 1 5,7% 5,0% AP 2 isolates with both P102H and A90V mutations gyrA A126R (GCG/AGG) 55 35 20 2 0 5,7% 0,0% gyrB N538D (AAC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 55 35 20 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 55 35 20 2 19 5,7% 95,0% Streptomycin No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Shi et al, 2007 rpsL K43R (AAG/AGG) 215 115 100 81 0 70,4% 0,0% "DHPLC analysis and sequencing. Hot spot in rpsL, 530, 912 loop and 1400 region of rrs" "Absolute concentration method. 43 MDR" China rpsL K88R (AAG/AGG) 215 115 100 7 0 6,1% 0,0% 2002-2004 rpsL K88Q (AAG/CAG) 215 115 100 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 215 115 100 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 215 115 100 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/T) 215 115 100 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 215 115 100 8 0 7,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 215 115 100 1 0 0,9% 0,0% rrs 906 (A/C) 215 115 100 1 0 0,9% 0,0% N/A Other AQ 215 115 100 8 0 7,0% 0,0% AQ 8 isolates had 6 different other mutations. 1 isolate had both rpsL K43R, rrs 462 (T/G) and rrs 645 del A mutations. 1 had both rpsL K43R and rpsL G71S (GGC/AGC) mutations. 1 had both rpsL K43R and rrs 1400 (A/G) mutations. 2 had both rpsL K43R and rrs 1401 (C/T) mutations. 2 had both rrs 513 (A/C) and rrs 645 del A mutations. N/A None detected 215 115 100 17 100 14,8% 100,0% Sun YJ et al, 2009 rpsL K43R (AAG/AGG) 148 102 46 82 0 80,4% 0,0% "Sequencing. Whole genes or rpsL and rrs" "BACTEC 460 N.S." Singapore rpsL K88R (AAG/AGG) 148 102 46 8 0 7,8% 0,0% 1994-1996 rpsL K88Q (AAG/CAG) 148 102 46 1 0 1,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 148 102 46 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 148 102 46 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 148 102 46 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/T) 148 102 46 3 0 2,9% 0,0% rrs 516 (C/T) 148 102 46 2 0 2,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 148 102 46 0 0 0,0% 0,0% N/A Other AQ2 148 102 46 1 0 1,0% 0,0% AQ2 1 isolate had 1 different other mutation, rpsL K88T N/A None detected 148 102 46 5 46 4,9% 100,0% Wu et al, 2006 rpsL K43R (AAG/AGG) 167 98 69 71 0 72,4% 0,0% "RDBH, SSCP, RFLP and sequencing. Hot spot in rpsL, 530 loop of rrs" "Absolute concentration method. 12 S, 54 MDR, 32 PDR" China rpsL K88R (AAG/AGG) 167 98 69 7 0 7,1% 0,0% 1999-2004 rpsL K88Q (AAG/CAG) 167 98 69 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 167 98 69 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 167 98 69 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 167 98 69 4 0 4,1% 0,0% rrs 513 (A/T) 167 98 69 1 0 1,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 167 98 69 1 0 1,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 167 98 69 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 167 98 69 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 167 98 69 14 69 14,3% 100,0% Brzostek et al, 2004 rpsL K43R (AAG/AGG) 103 88 15 27 0 30,7% 0,0% "Sequencing. Hot spot in rpsL and 530 and 912 loop of rrs" "BACTEC 460 and proportion method. N.S." Poland rpsL K88R (AAG/AGG) 103 88 15 3 0 3,4% 0,0% 2000 rpsL K88Q (AAG/CAG) 103 88 15 1 0 1,1% 0,0% rrs 491 (C/T) 103 88 15 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 103 88 15 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 103 88 15 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/T) 103 88 15 0 0 0,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 103 88 15 0 0 0,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 103 88 15 0 0 0,0% 0,0% N/A Other AR 103 88 15 11 0 12,5% 0,0% "AR 11 isolates had 16 different other mutations, rrs 461 (C/T), rrs 627 (G/C), rrs 906 (A/T) and T40I (ACC/ATC). 1 isolate had 12 different mutations in both rrs (not defined which but located upstream or downstream of loop 530) and rpsL; T41S, K51N, V52G, G84V, R86W and V87L." N/A None detected 103 88 15 45 15 51,1% 100,0% Sreevatsan et al, 1996 rpsL K43R (AAG/AGG) 139 78 61 39 0 50,0% 0,0% "Sequencing. Whole genes or rpsL and rrs" "BACTEC 460 and proportion method. N.S." Multiple countries rpsL K88R (AAG/AGG) 139 78 61 1 0 1,3% 0,0% N.S rpsL K88Q (AAG/CAG) 139 78 61 2 0 2,6% 0,0% rrs 491 (C/T) 139 78 61 1 0 1,3% 0,0% rrs 512 (C/T) 139 78 61 1 0 1,3% 0,0% rrs 513 (A/C) 139 78 61 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/T) 139 78 61 1 0 1,3% 0,0% rrs 516 (C/T) 139 78 61 1 0 1,3% 0,0% rrs 906 (A/C) 139 78 61 1 0 1,3% 0,0% N/A Other AS 139 78 61 5 0 6,4% 0,0% AS 5 isolates had 5 different mutations rpsL R9H (CGC/CAC), rpsL V93M (GTG/ATG), rrs 798 (C/T), rrs 877 (G/A) and 904 (A/G). 1 isolate had both K43R and R9H mutations. 1 isolate had both rpsL K88R and V93M mutations. 1 isolate had both rpsL K43R and rrs 798 (C/T) mutations. N/A None detected 139 78 61 29 61 37,2% 100,0% Gegia et al, 2008 rpsL K43R (AAG/AGG) 98 63 35 38 0 60,3% 0,0% "Sequencing. Whole gene rpsL, 530 and 912 loop of rrs" "Absolute concentration method. 15 MDR" Georgia rpsL K88R (AAG/AGG) 98 63 35 1 0 1,6% 0,0% 2006 rpsL K88Q (AAG/CAG) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 98 63 35 8 0 12,7% 0,0% rrs 513 (A/C) 98 63 35 3 0 4,8% 0,0% rrs 513 (A/T) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 98 63 35 3 0 4,8% 0,0% rrs 906 (A/C) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 98 63 35 10 35 15,9% 100,0% Mukaigawa et al, 2005 rpsL K43R (AAG/AGG) 98 63 35 38 0 60,3% 0,0% "Sequencing. Whole gene rpsL, 530 and 912 loop of rrs" "MGIT 960. 27 SM, 23 MDR, 11 PDR" Japan rpsL K88R (AAG/AGG) 98 63 35 1 0 1,6% 0,0% 2000-2003 rpsL K88Q (AAG/CAG) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 98 63 35 8 0 12,7% 0,0% rrs 513 (A/C) 98 63 35 3 0 4,8% 0,0% rrs 513 (A/T) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 98 63 35 3 0 4,8% 0,0% rrs 906 (A/C) 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 98 63 35 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 98 63 35 10 35 15,9% 100,0% "Streptomycin Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Peridgao et al, 2008 rpsL K43R (AAG/AGG) 58 51 7 34 0 66,7% 0,0% "Sequencing. Whole gene rpsL and rrs" "MGIT 960. All isolates MDR" Portugal rpsL K88R (AAG/AGG) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% 2003 rpsL K88Q (AAG/CAG) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/T) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 58 51 7 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 58 51 7 17 7 33,3% 100,0% Dobner et al, 1997 rpsL K43R (AAG/AGG) 63 50 13 15 0 30,0% 0,0% "Sequencing. Hot spot in rpsL and 530 and 912 loop of rrs" "Proportion method. About half of the isolates MDR" Germany, Sierra Leone rpsL K88R (AAG/AGG) 63 50 13 2 0 4,0% 0,0% 1997 rpsL K88Q (AAG/CAG) 63 50 13 1 0 2,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 63 50 13 2 0 4,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 63 50 13 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) AT 63 50 13 3 0 6,0% 0,0% AT 1 isolate had both rpsL K43R and rrs 513 (A/C) mutations rrs 513 (A/T) 63 50 13 0 0 0,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 63 50 13 1 0 2,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 63 50 13 0 0 0,0% 0,0% N/A Other AU 63 50 13 2 0 4,0% 0,0% AT 2 isolates had 2 different other mutations, rrs 905 (A/G) and rrs 906 (A/T). 1 isolate had both rpsL K88Q and rrs 905 (A/G) mutations N/A None detected 63 50 13 26 13 52,0% 100,0% Das et al, 2009 rpsL K43R (AAG/AGG) 69 49 20 27 0 55,1% 0,0% "RFLP and sequencing. 360 bp fragment of rpsL" "Resistance ratio method and Absolute concentration method. N.S" India rpsL K88R (AAG/AGG) 69 49 20 2 0 4,1% 0,0% N.S. rpsL K88Q (AAG/CAG) 69 49 20 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 512 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 513 (A/C) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 513 (A/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 516 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 906 (A/C) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 69 49 20 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 69 49 20 20 20 40,8% 100,0% Fukuda et al, 1999 rpsL K43R (AAG/AGG) 121 49 72 18 0 36,7% 0,0% "RFLP and sequencing. 360 bp fragment of rpsL" "Broth Microdilution method. N.S." Japan rpsL K88R (AAG/AGG) 121 49 72 4 0 8,2% 0,0% 1999 rpsL K88Q (AAG/CAG) 121 49 72 1 0 2,0% 0,0% rrs 491 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 512 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 513 (A/C) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 513 (A/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 516 (C/T) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A rrs 906 (A/C) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 121 49 72 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 121 49 72 26 72 53,1% 100,0% Spies et al, 2008 rpsL K43R (AAG/AGG) 79 47 32 19 0 40,4% 0,0% "Sequencing. 306bp fragment of rpsL and 530 and 912 loop of rrs, 675bp fragment of gidB." "Absolute concentration method. 9 SM, 27 MDR, 11 PDR " Brazil rpsL K88R (AAG/AGG) 79 47 32 0 0 0,0% 0,0% N.S. rpsL K88Q (AAG/CAG) 79 47 32 4 0 8,5% 0,0% rrs 491 (C/T) 79 47 32 4 0 8,5% 0,0% rrs 512 (C/T) 79 47 32 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 79 47 32 1 0 2,1% 0,0% rrs 513 (A/T) 79 47 32 3 0 6,4% 0,0% rrs 516 (C/T) 79 47 32 3 0 6,4% 0,0% rrs 906 (A/C) 79 47 32 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 79 47 32 27 28 57,4% 87,5% N/A None detected 79 47 32 5 4 10,6% 12,5% Liang J et al, 2004 rpsL K43R (AAG/AGG) 52 43 9 33 0 76,7% 0,0% "PCR-SSCP, chip hybridization, and Sequencing. Hot spot in rpsL and 530 and 912 loop of rrs" "N.S. All PDR or MDR" China rpsL K88R (AAG/AGG) 52 43 9 0 0 0,0% 0,0% N.S. rpsL K88Q (AAG/CAG) 52 43 9 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 52 43 9 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 52 43 9 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 52 43 9 5 0 11,6% 0,0% rrs 513 (A/T) 52 43 9 1 0 2,3% 0,0% rrs 516 (C/T) 52 43 9 0 0 0,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 52 43 9 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 52 43 9 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 52 43 9 4 9 9,3% 100,0% Wu et al, 1999 rpsL K43R (AAG/AGG) 57 40 17 29 3 72,5% 17,6% "PCR-SSCP and Sequencing. Hot spot in rpsL and 530 loop of rrs" "Absolute concentration method. Both monoresistant, PDR and MDR isolates" China rpsL K88R (AAG/AGG) 57 40 17 0 0 0,0% 0,0% N.S. rpsL K88Q (AAG/CAG) 57 40 17 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 57 40 17 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 57 40 17 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) AV 57 40 17 3 0 7,5% 0,0% AV 1 isolate had both rpsL K43R and rrs 513 (A/C) mutations rrs 513 (A/T) 57 40 17 0 0 0,0% 0,0% rrs 516 (C/T) 57 40 17 0 0 0,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 57 40 17 0 0 0,0% 0,0% N/A Other AW 57 40 17 1 0 2,5% 0,0% AW V33I (GTA/ATA). 1 isolate had both rrs 513 (A/C) and rpsL V33I mutations. N/A None detected 57 40 17 9 14 22,5% 82,4% Katsukawa et al, 1997 rpsL K43R (AAG/AGG) 46 36 10 10 0 27,8% 0,0% "Sequencing. Hot spot in rpsL and 530 and 912 loop of rrs" "Absolute concentration method. N.S" Japan rpsL K88R (AAG/AGG) 46 36 10 4 0 11,1% 0,0% 1992-1994 rpsL K88Q (AAG/CAG) 46 36 10 0 0 0,0% 0,0% rrs 491 (C/T) 46 36 10 0 0 0,0% 0,0% rrs 512 (C/T) 46 36 10 0 0 0,0% 0,0% rrs 513 (A/C) 46 36 10 8 0 22,2% 0,0% rrs 513 (A/T) 46 36 10 1 0 2,8% 0,0% rrs 516 (C/T) 46 36 10 0 0 0,0% 0,0% rrs 906 (A/C) 46 36 10 1 0 2,8% 0,0% N/A Other AX 46 36 10 4 0 11,1% 0,0% AX 4 isolates had 4 different other mutations, rpsL K88M (AAG/ATG), rpsL K88T (AAG/ATG), rrs 907 (A/G), 907-908 insT. N/A None detected 46 36 10 8 10 22,2% 100,0% Ethambutol No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Sugawara et al, 2005 embB M306I (ATG/ATA) 171 133 38 7 0 5,3% 0,0% "Sequencing. 206 bp of embB" "Proportion method. Only information about EMB " China embB M306I (ATG/ATC) 171 133 38 2 0 1,5% 0,0% 1996 embB M306I (ATG/ATT) 171 133 38 5 0 3,8% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 171 133 38 3 0 2,3% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 171 133 38 43 0 32,3% 0,0% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other AY 171 133 38 3 0 2,3% 0,0% AY 3 isolates had 3 different other mutations, Y319C (TAT/TGT), Y319C (TAT/GAT) and Y333H (TAT/CAT). N/A None detected 171 133 38 70 38 52,6% 100,0% Parsons et al, 2005 embB M306I (ATG/ATA) AZ1 157 128 29 16 0 12,5% 0,0% "Sequencing. Region with codon 306 and 406" "BACTEC 460 method. Both monoresistant, PDR and MDR isolates" AZ1 The nucleotide change was not specified for M306I mutations. M306I 2 isolates was heteroresistant population with both M306I, M306L and wild-type sequence. USA embB M306I (ATG/ATC) 157 128 29 0 0,0% 0,0% 1998-2004 embB M306I (ATG/ATT) 157 128 29 0 0,0% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 157 128 29 0 0 0,0% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) AZ2 157 128 29 53 0 41,4% 0,0% AZ2 4 isolates was heteroresistant population with both M306V and wild-type sequence. In addition 2 isolates was heteroresistant population with both M306I, M306L and wild-type sequence. embB G406D (GGC/GAC) 157 128 29 3 0 2,3% 0,0% embB G406S (GGC/AGC) 157 128 29 1 0 0,8% 0,0% embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 157 128 29 1 0 0,8% 0,0% N/A None detected 157 128 29 56 29 43,8% 100,0% Chan et al, 2007 embB M306I (ATG/ATA) 250 118 132 20 2 16,9% 1,5% "PCR-SSCP/MPAC and sequencing. 399 bp fragment" "Absolute concentration method. N.S." HongKong embB M306I (ATG/ATC) 250 118 132 7 0 5,9% 0,0% 1994-2004 embB M306I (ATG/ATT) 250 118 132 0 3 0,0% 2,3% embB M306L (ATG/CTG) 250 118 132 2 0 1,7% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 250 118 132 64 3 54,2% 2,3% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other AZ 250 118 132 4 0 3,4% 0,0% AZ 4 isolates had 2 different other mutations, Y334H (TAC/CAC) and Y319N (TAT/AAT). N/A None detected 250 118 132 21 124 17,8% 93,9% Hazbón et al, 2005 embB M306I (ATG/ATA) 1019 107 912 17 25 15,9% 2,7% "Molecular beacon assay and sequencing. 129 bp fragment" "BACTEC 460, MGIT 960 and absolute concentration method. 1 E, 94 MDR, 12 PDR" Multiple embB M306I (ATG/ATC) 1019 107 912 5 7 4,7% 0,8% 2005 embB M306I (ATG/ATT) 1019 107 912 4 1 3,7% 0,1% embB M306L (ATG/CTG) 1019 107 912 5 1 4,7% 0,1% embB M306V (ATG/GTG) 1019 107 912 22 13 20,6% 1,4% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other BA 1019 107 912 1 0 0,9% 0,0% BA M306L (ATG/TTG) N/A None detected 1019 107 912 53 865 49,5% 94,8% Plinke et al, 2006 embB M306I (ATG/ATA) 159 101 58 17 0 16,8% 0,0% "Sequencing. nt 764-1107" "Proportional method and BACTEC 460 . 1 E, 73 MDR, 27 PDR" Germany embB M306I (ATG/ATC) 159 101 58 5 0 5,0% 0,0% 2001 embB M306I (ATG/ATT) 159 101 58 4 0 4,0% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 159 101 58 0 0 0,0% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 159 101 58 42 0 41,6% 0,0% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other BB1 159 101 58 7 0 6,9% 0,0% BB1 7 isoaltes had 5 different other mutations, 1 with S297L (TCG/TTG), 1 Y319S (TAT/TCT), 3 D328V (GAT/GTG), 1 W332L (TGG/CTG) and 1 Y334H (TAC/CAC) N/A None detected 159 101 58 26 58 25,7% 100,0% "Ethambutol Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Wu et al, 2005 embB M306I (ATG/ATA) 197 90 107 15 2 16,7% 1,9% "PCR-SSCP and sequencing. Region around codon 306" "Absolute concentration method. 3 E, 46 MDR, 41 PDR" China embB M306I (ATG/ATC) 197 90 107 3 1 3,3% 0,9% 2005 embB M306I (ATG/ATT) 197 90 107 1 2 1,1% 1,9% embB M306L (ATG/CTG) 197 90 107 1 0 1,1% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 197 90 107 36 9 40,0% 8,4% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 197 90 107 0 0 0,0% 0,0% N/A None detected 197 90 107 34 93 37,8% 86,9% Zhang et al, 2006 embB M306I (ATG/ATA) 120 85 35 15 0 17,6% 0,0% "Oligobased hybridization assay, PCR-SSCP and DNA sequencing. N.S." "N.S. N.S." China embB M306I (ATG/ATC) 120 85 35 7 0 8,2% 0,0% N.S embB M306I (ATG/ATT) 120 85 35 2 0 2,4% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 120 85 35 1 0 1,2% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 120 85 35 25 0 29,4% 0,0% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 120 85 35 0 0 0,0% 0,0% N/A none 120 85 35 35 35 41,2% 100,0% Ramaswamy et al, 2000 embB M306I (ATG/ATA) BB2 108 75 33 11 0 14,7% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460, Agar diffusion method. N.S." BB2 The nucleotide change was not specified for M306I mutations. USA, Russia embB M306I (ATG/ATC) 108 75 33 0 0,0% 0,0% 2000 embB M306I (ATG/ATT) 108 75 33 0 0,0% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 108 75 33 1 0 1,3% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 108 75 33 7 0 9,3% 0,0% embB G406D (GGC/GAC) 108 75 33 2 0 2,7% 0,0% embB G406S (GGC/AGC) 108 75 33 1 0 1,3% 0,0% embB Q497R (CAG/CGG) 108 75 33 4 0 5,3% 0,0% N/A Other 108 75 33 58 4 77,3% 12,1% N/A None detected 108 75 33 18 29 24,0% 87,9% Wu et al, 2002 embB M306I (ATG/ATA) 107 69 38 7 0 10,1% 0,0% "PCR-SSCP, PCR-RFLP, Sequencing. Codon 237-324" "Proportion method. N.S." China embB M306I (ATG/ATC) 107 69 38 0 0 0,0% 0,0% N.S embB M306I (ATG/ATT) 107 69 38 1 0 1,4% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 107 69 38 1 0 1,4% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 107 69 38 16 0 23,2% 0,0% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other BC 107 69 38 1 0 1,4% 0,0% BC 1 isolate had both M306V and R274P (CGC/CCC) mutations N/A None 107 69 38 43 38 62,3% 100,0% Peridgao et al, 2009 embB M306I (ATG/ATA) 109 60 49 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Region around codons 306 , 406 and 497 of embB" "MGIT 960 and BACTEC 460. 2 E, 57 MDR, 1 PDR " Portugal embB M306I (ATG/ATC) 109 60 49 0 0 0,0% 0,0% 2003-2004 embB M306I (ATG/ATT) 109 60 49 0 0 0,0% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 109 60 49 1 0 1,7% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 109 60 49 32 8 53,3% 16,3% embB G406D (GGC/GAC) 109 60 49 0 0 0,0% 0,0% embB G406S (GGC/AGC) 109 60 49 0 0 0,0% 0,0% embB Q497R (CAG/CGG) 109 60 49 0 0 0,0% 0,0% N/A Other BD 109 60 49 1 0 1,7% 0,0% BD G497K (CAG/AAG) N/A None detected 109 60 49 26 41 43,3% 83,7% Hillemann et al, 2009 embB M306I (ATG/ATA) 106 52 54 8 0 15,4% 0,0% "Sequencing. Region around codons 306 , 406 and 497 of embB" "MGIT 960. All MDR" Germany embB M306I (ATG/ATC) 106 52 54 1 0 1,9% 0,0% N.S. embB M306I (ATG/ATT) 106 52 54 1 0 1,9% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 106 52 54 0 0 0,0% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 106 52 54 26 0 50,0% 0,0% embB G406D (GGC/GAC) 106 52 54 0 0 0,0% 0,0% embB G406S (GGC/AGC) 106 52 54 0 0 0,0% 0,0% embB Q497R (CAG/CGG) 106 52 54 0 0 0,0% 0,0% N/A Other BD 106 52 54 0 0 0,0% 0,0% BD G497K (CAG/AAG) N/A None detected 106 52 54 16 54 30,8% 100,0% Ahmad et al, 2007 embB M306I (ATG/ATA) 197 50 147 4 0 8,0% 0,0% "PCR-RFLP and sequencing. Region around codons 306 , 406 and 497 of embB" "BACTEC 460. 9 E, 11 MDR, 30 PDR " Kuwait embB M306I (ATG/ATC) 197 50 147 0 0 0,0% 0,0% 2000-2003 embB M306I (ATG/ATT) 197 50 147 0 0 0,0% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 197 50 147 1 0 2,0% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 197 50 147 10 3 20,0% 2,0% embB G406D (GGC/GAC) 75 50 25 0 0 0,0% 0,0% embB G406S (GGC/AGC) 75 50 25 2 0 4,0% 0,0% embB Q497R (CAG/CGG) 75 50 25 2 0 4,0% 0,0% N/A Other BD 197 50 147 1 0 2,0% N/A BD G497K (CAG/AAG) N/A None detected 197 50 147 35 144 70,0% 98,0% Plinke et al, 2009 embB M306I (ATG/ATA) 197 49 148 11 0 22,4% 0,0% "Squencing. 334bp region around codon 306 of embB" "Proportion method and MGIT 960. 50 MDR" Uzbekistan embB M306I (ATG/ATC) 197 49 148 7 0 14,3% 0,0% 2001-2002 embB M306I (ATG/ATT) 197 49 148 0 0 0,0% 0,0% embB M306L (ATG/CTG) 197 49 148 1 0 2,0% 0,0% embB M306V (ATG/GTG) 197 49 148 20 0 40,8% 0,0% embB G406D (GGC/GAC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB G406S (GGC/AGC) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A embB Q497R (CAG/CGG) N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A N/A Other 197 49 148 0 0 0,0% N/A N/A None detected 197 49 148 0 148 0,0% 100,0% Pyrazinamide No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Sheen et al, 2009 pncA -11 (A/G) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% "PCR-SSCP and sequencing. Whole gene" "BACTEC 460. 93 MDR, 16 PDR" Peru pncA V7G (GTC/GGC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% N.S. pncA Q10P (CAG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 163 109 54 1 0 0,9% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 163 109 54 2 0 1,8% 0,0% pncA nt 130 ins GG 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 163 109 54 13 0 11,9% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 163 109 54 1 0 0,9% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 163 109 54 2 0 1,8% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 163 109 54 8 0 7,3% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 163 109 54 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 163 109 54 74 2 67,9% 3,7% N/A None detected 163 109 54 7 53 6,4% 98,1% Pyrazinamide No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Chan et al, 2007 pncA -11 (A/G) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% "PCR-SSCP and sequencing. Whole gene" "MGIT 960. 89MDR, 2 PDR" Hong Kong pncA V7G (GTC/GGC) 250 89 161 0 2 0,0% 1,2% 1994-2004 pncA Q10P (CAG/CCG) 250 89 161 0 6 0,0% 3,7% pncA D12A (GAC/GCC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 250 89 161 1 0 1,1% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 250 89 161 1 0 1,1% 0,0% pncA nt 70 del G 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 250 89 161 1 0 1,1% 0,0% pncA nt 172 del T 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 250 89 161 3 0 3,4% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 250 89 161 1 0 1,1% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 250 89 161 1 0 1,1% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 250 89 161 23 0 25,8% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 250 89 161 2 0 2,2% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 250 89 161 3 0 3,4% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 250 89 161 1 0 1,1% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 250 89 161 9 0 10,1% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 250 89 161 0 0 0,0% 0,0% 1 isolate had both H57Y and S185T, 1 isolate had both Y103STOP and S185T mutations N/A Other 250 89 161 20 14 22,5% 8,7% 20 isolates had 20 different other mutations. 1 isolate had both V21G and 64 del A, 1 isolate had both W68L and nt 46 del G, 1 isolate had both L19P and nt 46 del G, 1 isolate had both P62L (CCG/CTG) and S185I (AGC/ATC), 1 isolate had both V9S (GTG/TCG) and K96T (AAG/ACG). N/A None detected 250 89 161 26 144 29,2% 89,4% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Somoskovi et al, 2007 pncA -11 (A/G) 294 83 211 6 0 7,2% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460. Only information about Z" N.S pncA V7G (GTC/GGC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% N.S. pncA Q10P (CAG/CCG) 294 83 211 2 0 2,4% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 294 83 211 2 0 2,4% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA nt 70 del G 294 83 211 14 0 16,9% 0,0% pncA nt 71 del G 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 294 83 211 0 42 0,0% 19,9% pncA H51R (CAC/CGC) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 294 83 211 13 0 15,7% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 294 83 211 3 0 3,6% 0,0% pncA nt 315 ins G 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 294 83 211 2 0 2,4% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 294 83 211 1 0 1,2% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 294 83 211 3 0 3,6% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 294 83 211 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 294 83 211 26 3 31,3% 1,4% N/A None detected 294 83 211 0 166 0,0% 78,7% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Louw et al, 2006 pncA -11 (A/G) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "MGIT 960. 1 Z, 61 MDR. 6 PDR" South Africa pncA V7G (GTC/GGC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% 2001-2002 pncA Q10P (CAG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 115 68 46 1 0 1,5% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 115 68 46 2 0 2,9% 0,0% pncA nt 172 del T 115 68 46 12 0 17,6% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 115 68 46 3 0 4,4% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 115 68 46 7 0 10,3% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 115 68 46 3 0 4,4% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 115 68 46 2 0 2,9% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 115 68 46 1 0 1,5% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 115 68 46 9 0 13,2% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 115 68 46 2 0 2,9% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 115 68 46 4 0 5,9% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 115 68 46 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 115 68 46 8 0 11,8% 0,0% 1 isolate had both H57Y and S185T, 1 isolate had both Y103STOP and S185T mutations N/A Other 115 68 46 19 10 27,9% 21,7% 19 isolates had 15 different other mutations. 1 isolate had both T114P and S179R (AGC/CGC), 1 isolate had both S185T and G37STOP (GAA/TAA) mutations. N/A None detected 115 68 46 6 36 8,8% 78,3% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Sreevatsan et al, 1997 pncA -11 (A/G) 118 67 51 2 0 3,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460 and proportion method. Only information about Z" Multiple pncA V7G (GTC/GGC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% N.S. pncA Q10P (CAG/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 118 67 51 1 0 1,5% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 118 67 51 7 0 10,4% 0,0% pncA nt 71 del G 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 118 67 51 1 0 1,5% 0,0% pncA nt 130 ins GG 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 118 67 51 11 0 16,4% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 118 67 51 1 0 1,5% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 118 67 51 1 0 1,5% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 118 67 51 1 0 1,5% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 118 67 51 8 0 11,9% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 118 67 51 1 0 1,5% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 118 67 51 4 0 6,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 118 67 51 2 0 3,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 118 67 51 1 0 1,5% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 118 67 51 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 118 67 51 7 0 10,4% 0,0% 7 isolates had 5 different other mutations. N/A None detected 118 67 51 19 51 28,4% 100,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Cheng et al, 2000 pncA -11 (A/G) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460 or proportion method. 21 Z, 18 MDR, 13 only tested for Z, 1 RO, 1 S, 1 R" Canada, USA, South Korea pncA V7G (GTC/GGC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% 1990-1992 pncA Q10P (CAG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 57 55 2 6 0 10,9% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 57 55 2 2 0 3,6% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 57 55 2 21 0 38,2% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 57 55 2 21 0 38,2% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 57 55 2 1 0 1,8% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 57 55 2 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 57 55 2 16 0 29,1% 0,0% 16 isolates had 15 different other mutations. 21 isolates had both R140S and nt 446 del 8 bp mutations. 1 isolate had both V130G and nt 420 ins GG mutations. N/A None detected 57 55 2 3 2 5,5% 100,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Peridgao et al, 2008 pncA -11 (A/G) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460. 36 MDR, 6 PZA." Portugal pncA V7G (GTC/GGC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% 2003 pncA Q10P (CAG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 58 48 10 1 0 2,1% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 58 48 10 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 58 48 10 47 0 97,9% 0,0% 33 resistant isolates had 21 different mutations. N/A None detected 58 48 10 0 10 0,0% 100,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Mphahlele et al, 2008 pncA -11 (A/G) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460. 36 MDR, 6 PZA." South Africa pncA V7G (GTC/GGC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% 2001-2002 pncA Q10P (CAG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 129 42 87 2 0 4,8% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 129 42 87 1 1 2,4% 1,1% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 129 42 87 2 0 4,8% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 129 42 87 1 0 2,4% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 129 42 87 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 129 42 87 35 0 83,3% 0,0% 33 resistant isolates had 21 different mutations. N/A None detected 129 42 87 3 86 7,1% 98,9% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Rodrigues et al, 2005 pncA -11 (A/G) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "Proportion method. 36 MDR, the rest had variable profiles" Brazil pncA V7G (GTC/GGC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% 1998-2003 pncA Q10P (CAG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 59 40 19 2 0 5,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 59 40 19 3 0 7,5% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 59 40 19 1 0 2,5% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 59 40 19 1 0 2,5% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 59 40 19 1 0 2,5% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 59 40 19 1 0 2,5% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 59 40 19 1 0 2,5% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 59 40 19 2 0 5,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 59 40 19 1 0 2,5% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 59 40 19 3 0 7,5% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 59 40 19 1 0 2,5% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 59 40 19 3 0 7,5% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 59 40 19 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 59 40 19 7 0 17,5% 0,0% 7 isolates had 7 different other mutations. N/A None detected 59 40 19 13 19 32,5% 100,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Martilla et al, 1999 pncA -11 (A/G) 44 36 8 5 0 13,9% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460. Only determined for PZA" Russia pncA V7G (GTC/GGC) 44 36 8 1 0 2,8% 0,0% 1994-1997 pncA Q10P (CAG/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 44 36 8 1 0 2,8% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 44 36 8 2 0 5,6% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 44 36 8 1 0 2,8% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 44 36 8 1 0 2,8% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 44 36 8 2 0 5,6% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 44 36 8 2 0 5,6% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 44 36 8 2 0 5,6% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 44 36 8 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 44 36 8 14 0 38,9% 0,0% 14 isolates had 14 different other mutations. N/A None detected 44 36 8 5 8 13,9% 100,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Morlock et al, 2000 pncA -11 (A/G) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "Proportion method. Only determined for PZA" USA pncA V7G (GTC/GGC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% N.S. pncA Q10P (CAG/CCG) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 60 35 23 2 0 5,7% 0,0% pncA nt 76 ins GC 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 60 35 23 0 3 0,0% 13,0% pncA H51R (CAC/CGC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 60 35 23 2 0 5,7% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA nt 389 ins GG 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 60 35 23 2 0 5,7% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 60 35 23 1 0 2,9% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 60 35 23 2 0 5,7% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 60 35 23 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 60 35 23 14 0 40,0% 0,0% 14 isolates had 14 different other mutations. N/A None detected 60 35 23 1 20 2,9% 87,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Martin et al, 2008 pncA -11 (A/G) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "Proportion method. 3 Z, 25 MDR, 3 other patterns" Multiple, Eastern Europe (Armenia, Georgis, Kazakstan, Russia, Azerbaijan) pncA V7G (GTC/GGC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA Q10P (CAG/CCG) 67 33 34 1 0 3,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% N.S. pncA G17D (GGC/GAC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 67 33 34 1 0 3,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 67 33 34 1 0 3,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 67 33 34 2 0 6,1% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 67 33 34 2 0 6,1% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 67 33 34 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 67 33 34 19 0 57,6% 0,0% 11 isolates had 11 different other mutations. N/A None detected 67 33 34 3 34 9,1% 100,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Hirano et al, 1997 pncA -11 (A/G) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "Proportion method. 3 Z, 25 MDR, 3 other patterns" Multiple, Asia and Canada pncA V7G (GTC/GGC) 168 33 135 2 0 6,1% 0,0% N.S. pncA Q10P (CAG/CCG) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 168 33 135 2 0 6,1% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 168 33 135 2 0 6,1% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 168 33 135 2 0 6,1% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 168 33 135 2 0 6,1% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 168 33 135 1 0 3,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 168 33 135 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 168 33 135 11 0 33,3% 0,0% 11 isolates had 11 different other mutations. N/A None detected 168 33 135 0 135 0,0% 100,0% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Juréen et al, 2008 pncA -11 (A/G) 69 32 37 1 0 3,1% 0,0% "Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460 21 MDR" Sweden pncA V7G (GTC/GGC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% N.S. pncA Q10P (CAG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 76 ins GC 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 130 ins GG 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 69 32 37 3 0 9,4% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 69 32 37 1 0 3,1% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 69 32 37 1 0 3,1% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 69 32 37 1 0 3,1% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 69 32 37 1 0 3,1% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 69 32 37 1 0 3,1% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 69 32 37 2 0 6,3% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 69 32 37 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 69 32 37 21 3 65,6% 8,1% 21 isolates had 19 different other mutations. N/A None detected 69 32 37 1 34 3,1% 91,9% "Pyrazinamide Cont." No. of isolates tested No. of isolates with mutation Proportion of tested with mutation Reference/ Country/ Time period Gene Mutation Total R S R S R S Molecular detection method/ Gene coverage DST method/ Resistance pattern among R isolates Comments Hou et al, 2000 pncA -11 (A/G) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% "PCR-SSCP and Sequencing. Whole gene" "BACTEC 460 and proportion method. 23 MDR, 8 PDR, 1 S" China pncA V7G (GTC/GGC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% 1996-1998 pncA Q10P (CAG/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA D12A (GAC/GCC) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA C14R (TGC/CGC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA G17D (GGC/GAC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA L19P (CTG/CCG) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA V21G (GTA/GGA) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 70 del G 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 71 del G 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA nt 76 ins GC 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA Y34S (TAC/TCC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA L35R (CTG/CGG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA Y41STOP (TAC/TAG) 65 35 30 2 0 5,7% 0,0% pncA nt 130 ins GG 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA A46V (GCA/GTA) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA T47A (ACC/GCC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA H51R (CAC/CGC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA H51P (CAC/CCC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA P54T (CCG/ACG) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA H57Y (CAC/TAC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 172 del T 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 182 ins 5bp 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA D63G (GAC/GGC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA S66P (TCG/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA S67P (TCG/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA W68R (TGG/CGG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA W68L (TGG/TTG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA W68G (TGG/GGG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA H71R (CAT/CGT) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA C72R (TGC/CGC) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA T76P (ACT/CCT) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA H82R (CAT/CGT) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA L85P (CTG/CCG) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA K96N (AAG/AAT) 65 35 30 2 0 5,7% 0,0% pncA G97S (GGT/AGT) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA Y99STOP (TAC/TAG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA A102V (GCG/GTG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA Y103STOP (TAC/TAG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA S104R (AGC/AGG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 315 ins G 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA T114P (ACG/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA L116R (CTG/CGG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA R121P (CGG/CCG) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA V128G (GTC/GGC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 388 ins AGGTCGATG 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA nt 389 ins GG 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA V130G (GTG/GGG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA A134V (GCC/GTC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA H137R (CAT/CGT) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA C138Y (TGT/TAT) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA V139M (GTG/ATG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA V139L (GTG/CTG) 65 35 30 1 0 2,9% 0,0% pncA V139A (GTG/GCG) 65 35 30 2 0 5,7% 0,0% pncA R140S (CGC/AGC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA Q141P (CAG/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA T142K (ACG/AAG) 65 35 30 3 0 8,6% 0,0% pncA nt 446 del 8bp 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA V155G (GTG/GGG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA L159P (GTC/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA T160P (ACA/CCA) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA A161P (GCG/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA G162D (GGT/GAT) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA A171E (GCG/GAG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA L172P (CTG/CCG) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% pncA S185T (AGC/ACC) 65 35 30 0 0 0,0% 0,0% N/A Other 65 35 30 14 0 40,0% 0,0% 14 isolates had 14 different other mutations. N/A None detected 65 35 30 3 30 8,6% 100,0% ND: Not determined N.S.: Not specified N/A: Not applicable RRDR: Rifampin resistance-determining region QRDR: Quninolone resistance-determining region MDR: Multi Drug Resistant PDR: Poly Drug Resistant (not MDR) DST: Drug Susceptibility testing PM: Proportion Method ACM: Absolute Concentration Method